Добрый день.
Цитата: В 2022 году мы создали ООО (УСН Доходы минус Расходы), в котором3 учредителя,один из которых является также гендиректоромкомпании....директор не был оформлен по трудовому договору, соответственно зарплата не выплачивалась и взносы тоже. Есть ли в этом нарушение законодательства?
Да, это нарушение. Договор должен быть оформлен не позднее трех рабочих дней со дня фактического допущения работника к работе (ст. 67 ТК РФ). Причины, по которой вы этого не сделали, роли не играют. Трудовой договор, не оформленный в письменной форме, считается заключенным, если работник приступил к работе. Уклонение от оформления трудового договора грозит штрафом по ст. 5.27 КоАП.
Цитата: В 2023 году у нас ожидается выполнение 2 контрактов, затем снова производство не будет функционировать до следующего лета. Можно ли нам обойтись без оформления по трудовому договору нашего директора?
Нет.
Цитата: Возможно ли оформление по ГПХ с выплатой небольшого вознаграждения за конкретно выполненную работу?
Нет. Руководитель не может работать по договору ГПХ, это трудовая функция.
Цитата: Или как Вы бы предложили поступить с максимальной выгодой для нас, не нарушая при этом законодательство
Оформить трудовой договор, начислять и платить зарплату, НДФЛ, взносы. На время отсутствия деятельности оформить отпуск без сохранения заработной платы.